La fondazione di Manarola, nel luogo dove si trova oggi, risale alla fine del 1100. Fu opera di antichi abitanti della collina, probabilmente discendenti da coloni romani, che scelsero questo sperone di roccia proteso sul mare per avvistare e difendersi meglio dalle incursioni dei pirati saraceni.
Manarola fu marchesato dei Signori di Carpena; all’inizio del 1200 il feudo apparteneva al Vescovo di Luni, che lo cedette in seguito ai Fieschi di Genova.

Qui a Manarola, dalla famiglia Fieschi, nacque Sinibaldo che divenne papa con il nome di Innocenzo IV, il pontefice che scomunicò Federico II ed indisse la VII Crociata.
Da menzionare il conflitto che 1882 oppose gli abitanti di Manarola al comune di Riomaggiore, accusato di volersi approriare illecitamente dei loro beni.
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